Monday, July 26, 2010
Husmor på barrikaderne, kan ikke finde gær!
Friday, July 23, 2010
Science blogging
"G-protein koblede receptorer (GPCR) er en type molekyler, der fungerer som vigtige kemiske sensorer i dyre-celler og modtager signaler fra fx hormoner, nerve-transmittere og duftstoffer. De er involveret i en lang række sygdomme fra kræft til fedme og HIV og er derfor også på nuværende tidspunkt den type molekyler, de fleste lægemidler udfører deres effekt gennem."
En pige der er syg
"Den beta-2 adrenerge receptor (beta-2AR) er en del af GPCR familien og er en af de mest velkarakteriserede receptorer i familien. Beta-2AR er bl.a. vigtig for regulering af blodtryk. Stoffer, der hæmmer denne receptor, kaldes beta blokkere og bruges ofte i behandling af forhøjet blodtryk."
Her kommer lige et par billeder til at fange interessen, kort fortalt det handler om forhøjet blodtryk (hvem kender ikke til det) og medicinen det hjælper på forhøjet-blodtryk:
Så er baggrunden for projektet fortalt og her kommer så en fortælling om hvad det er jeg vil lave af forsøg:
"Projektet søger at kortlægge, hvorledes den tredimensionelle struktur af beta-2AR molekylet ændrer sig, når det aktiveres. Denne viden kunne hjælpe til at designe bedre og mere specifikke lægemidler i fremtiden."
Ja ja det siger de allesammen...
"De første tredimensionelle strukturer af beta-2AR i dens inaktive form blev publiceret af professor Kobilkas laboratorium for 2 år siden."
Ja det er så på hans laboratorie jeg befinder mig!
"For at studere aktiveringsprocessen og dynamikken af beta-2AR vil vi anvende en særlig metode (kaldet NMR), som giver direkte information om den tredimensionelle struktur, og hvorledes den ændrer sig, når man tilsætter forskellige aktiverende eller inaktiverende stoffer til receptoren."
"Ved at mærke forskellige dele af receptoren med NMR-aktive markører, kan vi i et enkelt eksperiment undersøge, hvordan forskellige dele af receptorerne ændrer sig på samme tid."
Så er det den vakse læser tænker, jamen sig mig hvordan har I tænkt jer at gøre det? Det skal jeg fortælle jer! Vi har nogle insektceller som vi sørger for udtrykker vores receptor. Ved at fodre cellerne med et specielt medie der indeholder en aminosyre der har en NMR-aktiv markør sørger vi for at de receptorer insektcellerne udtrykker er mærkede med NMR-aktive markører. Så skal vi bare have adskilt de receptorer vi er interesserede i fra resten af hvad der er i sådan en celle (DNA, fedt, andre proteiner, enzymer, RNA osv. osv.). Det gør vi i flere forskellige trin, hvor et er dem er at vi har en søjle lavet af et specielt materiale der binder receptoren.
"Viden om, hvad der foregår af tredimensionelle ændringer af strukturen under aktivering kan hjælpe til en bedre forståelse af hvordan lægemidler binder til receptorer og hvilke dele af receptorerne, der ændrer sig når forskellige lægemidler binder."
Indtil videre går det meget fint med projektet, vi har testet forskellige prøver, og prøver nu at finde ud af hvad alle vores data betyder! Forhåbentligt betyder det noget spændende, så jeg i nærmeste fremtid kan skrive et lille blog-indlæg om hvordan man aktiverer sådan en receptor.